尊龙凯时
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基因组测序>
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基因分型>
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质谱分析>
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蛋白组学分析>
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分子育种>
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基因合成>
16S、18S、ITS等扩增子测序（二代） 一步到位检测环境微生物多样性
扩增子测序是对特定长度的PCR产物或捕获的片段进行测序，分析序列中的变异。16S/18S/ITS等扩增子测序即通过提取环境样品的DNA，选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的目标区域，
通过检测目标区域的序列变异和丰度，以研究环境微生物多样性及群落组成差异。
16S/18S rDNA为编码原/真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。
ITS分为两个区域：ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之间，ITS2位于5.8S和28S之间。
应用方向
医学领域：疾病与人体微生物间关系，如代谢类疾病、消化类疾病、自身免疫性疾病、肿瘤癌症、神经类疾病及其他疾病等环境领域：某一特定环境（雾霾、沙尘等污染环境，住宅、商场等生活环境）的微生物群落组成，有机肥发酵处理、污水治理、石油降解、水体及海洋等微生物群落分布和组成等
畜牧领域：肠道、瘤胃等微生物与动物繁殖、生长发育、营养健康、免疫和疾病治疗等的互作关系
农业领域：根际微生物与植物互作、农业耕作/施肥处理与土壤微生物群落等
生物能源：特殊功能的菌株、工程菌的开发
特殊极端环境：极端环境条件下的微生物类群研究
尊龙凯时优势
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1.读长长, 周期短, 性价比高
采用 NovaSeq 6000 测序平台。NovaSeq 6000 测序平台通量更高，速度更快，运行时间更短，周期最短可达10天 -
2.科学方案设计
从材料选取，建库测序，到数据分析， 每一步都需要科学、缜密的设计，以保障高质量研究成果60人
分析团队9年
项目经验100000+
结题项目1对1
项目服务
信息分析
基于目标区域的测序，检测序列丰度，以充分研究环境微生物多样性和群落结构差异性。除QIIME1流程外，尊龙凯时还实现全流程QIIME2分析，QIIME2中的插件DADA2可以修正测序错误，注释更为精准，且提供了多种可交 互式图形系统展示，详细介绍见“QIIME2为你而来”| 标准分析 | 解决问题 |
|---|---|
| 物种注释 | 物种注释及各物种丰度信息 |
| α-多样性分析 | 微生物群落的丰富度和多样性 |
| β-多样性分析 | 不同样本间的微生物群落 及各样本差异情况 |
| 多元统计分析 | 寻找组间具有显著差异的物种， 同时可以比较组内差异和组间差异 的大小，判断分组是否有意义 |
| CCA分析 | 研究物种组成与环境因子间的关系 |
| 环境因子关联分析 | |
| VPA分析 | |
| 功能预测 | 预测样本的功能组成 |
| 高级分析 | 解决问题 |
|---|---|
| 肠型分析 | 肠道菌准确定位和疾病预测和治疗 |
| 贝叶斯网络图 | 判断微生物之间、微生物和环境、 代谢物间的依赖关系 |
| Source Tracker | 样本中微生物群落来源 |
送样建议
| 样本类型 | 建议送样量 | 最低送样量 |
|---|---|---|
| 土壤/污泥/沉积物/腐殖质 | 3g | 0.5g |
| 水体滤膜(孔径 0.22-0.45μm/直径 3-4cm) | 2张 | 1张 |
| 拭子 | 3个 | 1个 |
| 瘤胃液/发酵液/组织液(离心有明显沉淀) | 3mL，沉淀1g | 1mL，沉淀0.5g |
| 粪便/肠道内容物 | 2g(小鼠 6 粒) | 0.5g(小鼠 3 粒) |
| 动物/人组织 | 1g | 0.5g |
| 血浆 | 3mL | 1mL |
| 鲜奶 | 20mL | 8mL |
常见问题
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1.16S测序哪个区域比较合适？
- 尊龙凯时提供的几个测序区域来自文献调研，但是目前并没有研究表明哪个测序区域更好。有文章研究表明土壤样本，16S V4区（515F-806R）比较适合做扩增子研究，可检测的物种多样性更丰富， 并且可重复性强（PNAS. 2013. 110(16): 6548-6553.）。
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2.若关注环境中的真核微生物多样性，ITS测序和18S测序哪个更好?
- ITS测序主要是针对真菌多样性的研究，注释准确度高；18S测序针对的是真核微生物，注释到的范围广，但是就真菌来说精确度相对较低；可根据研究目的合理选择测序方案。
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3.扩增子与宏基因组的区别？
- 扩增子主要分为16S、18S、ITS测序，关注环境样本中的物种组成，该技术物美价廉，实用性高。宏基因组关注环境样本中的物种组成、功能组成及代谢通路等信息，该技术深入挖掘环境样本功能层面的信息。
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4.样本送到公司，什么时候可以拿到结果？
- 自样本检测合格之后开始计算周期，包括建库、测序、数据分析、结题。扩增子周期共计20个自然日。
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