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多组学联合分析

微生物多组学组合形式

  • 微生物组 + 蛋白质组 / 代谢组

    利用 16s、宏基因组技术,分析菌群组成和丰度情况,并采用代谢组技术分析菌群产生的代谢物变化,其次通过蛋白质组和代谢组技术对血液样本进行检测,研究肠道菌群与蛋白质和代谢分析的调控机制关系。

尊龙凯时微生物多组学技术优势

  • 全面的分析内容

    16S rDNA(二代 / 三代),宏基因组(二代 / 三代),代谢组,蛋白质组等分析内容应有尽有
  • 专业的技术团队

    专人专项,团队人员均具有丰富的项目经验,为您保驾护航
  • 灵活的组合方式

    各组学数据可以自由组合,研究方法更灵活,从多组学层面互相验证,提高结果可信度和重要性

多组学取样建议

样本类型 建议送样量 建议每组重复样本数
扩增子(二代 / 三代) 土壤 / 污泥 / 沉积物 / 腐殖质 3-5g ≥ 8
拭子 3-5 个 ≥ 8
瘤胃液 / 发酵液 / 组织液(离心有明显沉淀) 3-5mL ≥ 30
粪便 / 肠道内容物 2-5g ≥ 30
动物 / 人组织 1-3g ≥ 30
血浆 3-5mL ≥ 30
鲜奶 20mL ≥ 30
二代宏基因组
土壤 / 污泥 / 沉积物 / 腐殖质 3g ≥ 8
拭子 5-10 个 ≥ 30
瘤胃液 / 发酵液 / 组织液 / 冲洗液(离心有明显沉淀) 3-5mL,沉淀 1g ≥ 30
粪便 / 肠道内容物 2g(小鼠 6-10 粒) ≥ 30
动物 / 人组织 1g ≥ 30
牛奶 / 酸奶 30mL/50g ≥ 30
食糜 2g ≥ 30
食品表面拭子 10 个 ≥ 30
三代宏基因组
土壤 / 污泥 / 沉积物 / 腐殖质 6g ≥ 8
瘤胃液 / 发酵液 / 组织液 / 冲洗液 ( 离心有明显沉淀 ) 2g 6-10mL,沉淀 ≥ 30
粪便 / 肠道内容物 5g ≥ 30
动物 / 人组织 2g ≥ 30
牛奶 / 酸奶 100mL/100g ≥ 30
食糜 4g ≥ 30
食品表面拭子 20 个 ≥ 30

信息分析内容

扩增子 宏基因组 三代宏基因组 蛋白质组 代谢组
OTU聚类或ASV聚类
α多样性
β多样性
组间物种差异分析
组间群落结构差异分析
环境因子关联分析
Network 分析
高级分析
宏基因组组装
宏基因组基因预测
宏基因组物种注释和功能
注释
基于物种和功能注释结果
多样本标准分析
二代数据对三代组装结果
矫正
抗性基
单菌基因组分析
因 & 转移元件
病毒基因组
差异表达分析
功能富集分析
蛋白互作分析
定量分析
差异分析
通路富集分析

扩增子、宏基因组、三代宏基因组 + 代谢组 / 蛋白质组

分析点 解决问题
kegg 数据库关联分析 结合代谢通路差异分析结果以及代谢组结果,与差异菌群进行关联分析,找出与核心微生物相关的代谢物 以及代谢通路
差异分析 通过血液蛋白质组或代谢组的差异分析 ( 非肠道疾病一般会用血液的蛋白质组,免疫因子或代谢组等 ),确 定调控疾病的可能功能分子
核心菌群的基因组与功能挖掘 结合三代 Meta 数据中组装出单菌,并对其进行基因功能注释和挖掘,探究该菌在基因组层面上存在哪些 基因或者基因簇,会影响疾病的发展
比较基因组分析 对关键基因簇进行比较基因组分析,探究健康组、患病组的核心微生物基因组的该基因簇在结构上是否有 差异,进一步从机制上探究了健康组、患病组代谢物差异的原因
诊断治疗模型建立与预测 从代谢物维度与微生物组成维度对样品进行无监督聚类,将患病人群进行分类,构建训练集,创建更加科 学的判定方式
随机森林 运用随机森林分类器,将健康组与患病组的微生物菌群组成构建成模型,找出 Biomarker,运用差异微生 物物种或代谢物构建出可判别患病与治愈后的模型

部分分析内容展示

a. 基因数目稀释曲线 b,c 微生物基因计数和α多样性 [1] 相对丰度统计 [1] 基于 CAG 的不同群体 GM 富集的比较分析[1] KEGG 模块的平均丰度在对照组、pHTN 和 HTN 肠道微生物组中差异富集 [1]

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