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单细胞测序

10x Visium 空间转录组

  • 1. SpaceRanger 统计并展示组织中 UMI/Gene 个数在组织空间上的分布



  • 2. graphclust_Spatial:cluster 的空间分布图



  • 3. 多样本聚类整合分析各样本中 cluster 空间分布图



  • 4. 空间特异表达基因分析



  • 5. 肿瘤特征分析



  • 6. 通过 CellPhoneDB 进行配受体分析



  • 7. 轨迹(trajectory)、拟时序(pseudotime)分析



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