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多组学联合分析

表观组学(染色质微环境)

常见的表观组及染色质微环境研究有DNA甲基化、RNA甲基化、DNA与蛋白互作、染色质可及性和染色质互作等,这些修饰的改变对机体生理过程的发生发展等都有着重要的影响。

分析思路

应用方向

  • DNA甲基化:

    DNA甲基化参与基因表达调控、基因沉默、DNA损伤修复以及癌症发生等重要生物学过程,是研究最深入的表观遗传调控机制之一。
  • Hi-C:

    Hi-C技术利用高通量测序技术,结合生物信息学分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,构建染色体跨度单体型,同时捕获不同基因座位上之间的空间交互信息,获得高分辨率的染色质三维结构信息,并能开发调控基因的DNA元件。
  • ATAC-seq:

    ATAC-seq技术通过转座酶对某特定时空下开放的核染色质区域进行切割,进而获得在该特定时空下基因组中所有活跃转录的调控序列,是一种创新的染色质开放性研究技术。
  • RNA 甲基化(m6A 修饰):

    m6A是真核生物mRNA最常见的一种转录后修饰,可参与调节生物体中多种生物学过程,在细胞加速mRNA代谢和翻译以及在细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用,是当今最热门的研究领域之一。
  • ChIP-seq:

    ChIP-seq结合了染色质免疫共沉淀技术(ChIP)和高通量测序技术,能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白修饰、转录因子等互作的DNA区段,已成为检测DNA靶位点与其相应转录因子(TF)、表观遗传组蛋白修饰以及染色质重塑的体内相互作用不可或缺的技术。
  • CUT&Tag:

    研究DNA与蛋白互作的革新技术。使用Protein A/G融合的转座酶,在抗体引导下对靶蛋白结合位点附近进行DNA的片段化。可以真实的反映细胞内蛋白因子和基因组DNA的结合情况,广泛应用于动植物的表观遗传研究。

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