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表观组测序

与参考基因组比对

  • 严格的比对率、比对质量

利用软件,将读段与参考序列进行比对。

peak峰检出

  • 反应peak的分布及序列偏好

利用软件完成峰检分析(peak calling),并对峰的个数、宽度、分布等进行统计,
反应peak峰的整体分布情况,统计峰顶分布情况,模体分析(Motif search ) 。

相关基因富集分析

  • GO富集分析

Gene Ontology(GO)是基因功能国际标准分类体系。对相关基因做GO富集分析,
可以挖掘出差异peak相关基因相关的生物学功能,细胞组成,生物学过程。

相关基因富集分析

  • KEGG富集分析

在生物体内,不同基因相互协调行使其生物学功能,通过Pathway显著性富集
能确定相关基因参与的生化代谢途径和信号转导途径。

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