尊龙凯时

尊龙凯时

 > 

资源中心

 > 

送样建议

宏转录组测序

声明:
实验室不接收《人间传染的病原微生物名录》(点击查看)的所有样品。对于高毒性动植物等样品,必须事先通过销售、客服或运营经理与尊龙凯时技术人员联系,确定无高致病性和传染性后才能寄送样品。
提取风险提示和注意事项:核酸提取质量与物种及组织部位、采集方法及保存状态、提取方法及操作、实验器材及环境等因素均有密不可分的联系,尤其是三代超长提取对样本的要求更高。组织提取时可能受到上下游处理操作的影响,因此较难保证单次提取满足质量要求,客户应在寄送组织样品前进行备份。为了保障获得高质量的核酸,请务必按照送样手册所规定的准备样本。对珍贵样本或者微量样本,建议自行提取。取样过程中,需要全程佩戴手套,并且使用预冷乙醇对取样器材进行擦拭消毒,以免样本污染

1. 送样建议

  • 1.1 组织类样本

    样本类型 送样量 样本保存和运输 注意事项
    新鲜动物组织 ≥500mg 将组织放入旋盖冻存管中密封好,迅速置于液氮中速冻,-80℃保存,干冰运输 取相应部位组织,尽量将组织切成1cm2左右的小组织块
    新鲜植物组织 ≥800mg

  • 1.2 粪便类样本

    样本类型 送样量 样本保存和运输 注意事项
    粪便 ≥1g,建议3g 将挖取的粪便放入采样管中,密封好,液氮速冻,-80℃保存,干冰运输 受试者尽量避免有疾病(肠道炎症、癌症等)史,避免有手术等医疗干预
    粪便样本处理方法:
    (1)用采样管中无菌勺挖去粪便中段(基本不接触空气等其他媒介)的部分(3-5g),小鼠粪便至少在3-5粒;

  • 1.3 其他样本

    样本类型 送样量
    total RNA 浓度:≥ 50ng/μL
    体积:20μL ≤ V ≤ 120μL
    总量:≥ 1μg
    菌体/菌丝 ≥ 1*107
    ≥ 0.5
    肠道内容物 0.5-1g
    活性污泥/淤泥/沉积物类 10-15mL(约4-5g沉降物)
    土壤 ≥ 2g(建议富集菌体沉淀)
    肠道内容物类处理方法:
    (1)实验对象死亡后,无菌解剖刀于无菌环境中取出整个肠道,选择切取所需肠段(如回肠、结肠、盲肠等);
    (2)无菌手术刀挖取内容物置于无菌离心管中,液氮速冻至少4h以上,后与-80℃保存,干冰运输。
    注意:一般单个样本500-1000mg/管内容物。为保证实验顺利进行,尽可能多采集保存样品。
    活性污泥/淤泥/沉积物类(需自行提取):
    1)从活性污泥装置中取至少10-15ml的活性污泥样本(约4-5g沉降物);或者取距离水底/地表0-10cm的沉积物约5-10g;
    2)保存在无菌离心管中,液氮速冻并放置于-80℃保存。
    3)RNA提取。液氮速冻,干冰送样。
    土壤(需自行提取):
    (1)土壤样本低温环境(2-8℃)运送至实验室,先2mm筛网过筛,取5-10g保存于无菌离心管中,用RNAlater浸泡,保证全部浸泡在RNAlater中,4℃过夜孵育,随后高速离心去除RNAlater,-80℃保存;
    (2)土壤样本细菌含量比较低,或含有大块砂石,可先加入无核酸酶的生理盐水或1×PBS,匀浆,自然沉降或低速离心(≤100g,1-2min),吸取上层浑浊液体,放入新的1.5ml或2ml离心管,高速离心(≥8000g10min)弃上清,取沉淀后,再用RNAlater处理。
    (3)沙质土壤,建议2-8℃(冰袋)寄送,并标明处理前4℃冰箱存放,由实验室进行处理。
    (4)提取RNA,液氮速冻,-80℃保存,干冰送样。
    注意:样本准备过程中所用的离心管必须是无菌无RNA酶的离心管;送样用到RNAlater,务必注明是RNAlater保存的,尽量不要冻结,4℃过夜后,需高速离心去除RNAlater才可冷冻;RNAlater使用量:500mg土壤加1-1.5mlRNAlater,充分混匀。
    病毒液送样建议:
    宏病毒组可接的样本类型主要为病毒样本;有传染性或者是未知传染性、对人体有害的病毒不接(参考病原微生物实录);另外病毒液需要送提取好的RNA。样本均液氮速冻,-80℃保存。

2. 注意事项

(1)宿主类、环境类样本建议至少10G数据量;粪便类5G数据量;
(2)建议送新鲜样本;选取微生物含量较多的部分送样;
(3)务必明确做宏转录组分析还是病毒组分析;
(4)送样前备注样本类型、物种、部位、样本量、保存时间;
(5)组织类样本切记不可反复冻融。反复冻融样本不建议送样;样本存放时间:-80℃不超过3个月;
(6)发酵类请富集菌体后送菌体沉淀;
(7)陈皮等类似样本无法做宏转录组。

3 样本打包及寄送建议

  • 3.1 样本的打包

    (1)核酸样品建议使用质量好的1.5ml或2ml 低吸附EP管装载样品,并用封口膜封口。为了防止样品管破裂,或者污染和混乱,请不要使用诸如PCR管、0.5ml EP管、八联管、96孔板、深孔板等非标准管送样。非标准管不利于样品保存以及后续实验的进行。如有样品使用非标准管制备,还请在送样前自行转管处理。
    (2)组织样本建议根据送样量使用合适规格带螺纹帽的EP管、冻存管或者离心管装载组织样品,并用封口膜封口。
    (3)为防止样品管在运输过程中受到干冰挤压破裂,最好将样品管放到50ml离心管或其他支撑物中,并在支撑物里添加棉花或卫生纸缓冲。大量样品建议将EP管放置在冻存盒中,并在冻存盒外面包裹气泡垫。如使用锡箔纸、自封袋装载的样品,为防止运输中受挤压破损,建议将锡箔纸折叠整齐装在自封袋中,在样品包装外再用气泡垫包好并固定。
    (4)对于血液样品,建议采用5-10ml 塑料抗凝采血管装载,为了防止运输过程中采血管因挤压而损坏,需要将每支采血管管身均用气泡垫包好,然后放置到塑料或纸质包装盒中。
    (5)用乙醇沉淀的样品由于运输中会有少量乙醇挥发出,建议将样品管盖用封口膜缠绕4-5圈。
    (6)为便于处理和保存,组织样品送样量请不要超过建议送样量的5倍(特殊的得率较低的样品除外)。
  • 3.2 样本的名称标识

    (1)所有的样品必须具有清晰的标记,并且简洁明了。
    (2)使用锡箔纸包装的组织样品建议在锡箔纸内外均标记样品名称,并将锡箔纸放在自封袋中,自封袋外面再标记上样品名称,防止锡箔纸上样品名称模糊引起样品混乱。
    (3)使用乙醇沉淀的核酸样品,由于挥发出的乙醇会使记号笔的标记模糊,建议用油性记号笔将样品名称写在标签纸上,然后用透明胶带将标签纸粘贴在样品管壁上,并缠绕2-3圈。
    (4)样品名称建议使用“字母+数字”命名方式标注在管盖。其他信息如日期、浓度、物种等可标注在管壁。所有标注内容需与《样品信息单》保持一致。

Copyright@2011-2024 All Rights Reserved    版权所有:尊龙凯时    京ICP备15007085号-1

一对一业务咨询

一对一业务咨询

在线客服

联系方式

联系电话

400-658-1585

企业邮箱

service@novogene.com
返回顶部
Sitemap