基因组测序>
建库测序>
人类基因组测序>
动植物基因组测序>
微生物基因组测序>
转录调控测序>
表观组测序>
单细胞测序>
空间转录组>
基因分型>
质谱分析>
蛋白组学分析>
代谢组学分析>
免疫定量>
多组学联合分析>
分子育种>
基因合成>
研究背景
测序得到的原始测序序列(Sequenced Reads)或者 raw reads,里面含有带接头的、低质量的reads,为了保证信息分析质量,必须对raw reads过滤,得到clean reads,后续分析都基于clean reads。在测序过程中会存在一定的错误率,测序错误率分布检查可以反映测序数据的质量。差异基因聚类
基于宿主的差异分析结果 , 通过对比较组合中差异基因取并集的方式 , 获得本批次样本全部的差异基因。 分别将宿主以及寄主的差异基因通过 K-means 进行聚类 , 获得在样本中的表达模式相近的基因。不同 cluster 中基因的功能注释
将不同 Cluster 中的基因进行功能注释(GO/KEGG/Interpro 或 Swissport)后 , 将各 Cluster 样品注释结果以热图形式展示。模块层次聚类树
根据基因间表达量的相关性构建聚类树,并划分模块。其中 Merged dynamic 为根据模块相似度对表达模式相似的模块进行合并后的模块划分。之后的分析按照合并后的模块进行。对于上半部分的树图,纵向距离代表两个节点间(基因间)的距离,横向距离无意义。Copyright@2011-2024 All Rights Reserved 版权所有:尊龙凯时 京ICP备15007085号-1